公办大学、民办大学和独立学院都是中国高等教育体系的重要组成部分，它们之间的主要区别体现在以下几个方面：
办学主体
公办大学：由国家政府或地方政府资助创立维持的高等院校。
民办大学：由企业事业组织、社会团体及其他社会组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，面向社会举办的高等学校。
独立学院：实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合作，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校，属于民办性质。
办学层次
公办大学：包括本科院校和高职（专科）院校等。
民办大学：同样包括本科和专科院校。
独立学院：一定是本科院校。
学历证书
公办大学和 民办大学：毕业生都可以获得国家承认的学历证书，毕业证书可以在中国高等教育学生信息网上查询。
独立学院：毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，区别于母体学校的毕业证书。
学费
公办大学：学费在4000-6000元/年左右。
民办大学：学费在16000-30000元/年左右。
独立学院：学费在16000-20000元/年左右。
办学地点和资源共享
独立学院：一般是设在某个大学的名下，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流，但也有一些独立学院和母体没有多大联系。
民办大学：有独立的校名、组织机构、师资、校园，并独立颁发毕业证书。
建议
在选择高校时，学生和家长应根据自身的实际情况和需求，综合考虑学费、办学层次、学历证书以及学校的教育质量和就业情况等因素，做出明智的选择。独立学院虽然依托于公办高校的品牌资源，但独立运营和招生，学生在选择时应仔细考察其与母体高校的联系和办学质量。