根据教育部公布的第四轮学科评估结果以及多个权威排名机构的推荐，国内软件工程专业最强的大学排名如下：
北京航空航天大学：
被教育部评为A+，综合教学实力全国第一，尤其在嵌入式系统、航空航天软件等方面具有独特优势。
浙江大学：
被教育部评为A+，软件工程专业实力强劲，注重培养学生的创新思维和实践能力，在人工智能、大数据处理等领域有独特优势。
国防科技大学：
被教育部评为A+，作为军事院校，其软件工程专业注重培养学生的系统设计和安全防。
北京大学：
被教育部评为A，依托其强大的计算机科学基础，注重理论与实践相结合，培养了大量优秀的软件工程人才。
清华大学：
被教育部评为A，拥有雄厚的师资力量和先进的教学设施，科研成果丰硕，毕业生就业前景广阔。
华东师范大学：
被教育部评为A，软件工程专业在全国排名中位列第一，拥有完善的课程体系和优秀的科研团队。
南京大学：
被教育部评为A，注重理论与实践的结合，拥有多个国家级科研项目和实验室。
武汉大学：
被教育部评为A，软件工程学科实力强大。
上海交通大学：
被教育部评为A，拥有高水平的师资队伍和科研平台，注重培养学生的创新思维和工程实践能力。
哈尔滨工业大学：
被教育部评为A，在工科领域实力强劲，软件工程专业排名前列。
建议学生在选择软件工程专业时，可以优先考虑这些排名靠前的大学，并根据自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的学校。