云南最好的水利大学排名如下：
云南农业大学
云南农业大学在农业水利工程、水文与水资源工程、水务工程等多个水利相关专业中均排名第一。
昆明理工大学
昆明理工大学在农业水利工程、水务工程等专业中排名第二。
云南工商学院
云南工商学院在水利水电工程专业中排名第三。
保山学院
保山学院在水利水电工程专业中排名第四。
云南经济管理学院
云南经济管理学院在水利水电工程专业中排名第五。
昆明学院
昆明学院在水利水电工程专业中排名第六。
云南水利水电职业学院
云南水利水电职业学院在水利水电建筑工程专业中排名第五。
这些排名综合了不同年份和不同来源的数据，因此排名可能有一定的波动。建议在选择学校时，可以综合考虑学校的教学质量、专业设置、毕业生就业情况等多方面因素。