南京的一本大学及其推荐专业如下：
南京大学 王牌专业：
物理学、化学、天文学、地质学、文学、历史学、哲学、中国语言文学、软件工程、计算机科学与技术、经济学、金融学、法学。
其他推荐专业：电子科学与技术、信息工程、城乡规划、电气工程及其自动化。
东南大学 王牌专业：
电子科学与技术、建筑学、信息工程、城乡规划、电气工程及其自动化、交通工程。
其他推荐专业：生物医学工程、机械工程等。
南京航空航天大学 王牌专业：
飞行器设计与工程、航空宇航科学与技术、机械工程、电气工程及其自动化、交通运输。
其他推荐专业：生物医学工程、材料科学与工程等。
南京理工大学 王牌专业：
武器系统与运用工程、兵器发射理论与技术、材料科学与工程、电子信息工程。
其他推荐专业：自动化、机械工程、化学工程与工艺等。
河海大学 王牌专业：
水利工程、水文与水资源工程、港口航道与海岸工程、环境科学与工程。
其他推荐专业：农业资源与环境、食品科学等。
南京农业大学 王牌专业：
作物学、植物保护、农业资源与环境、兽医学、食品科学。
其他推荐专业：科学技术史、畜牧学、公共管理等。
南京医科大学
推荐专业：
预防医学、医学影像学、临床医学、临床药学、口腔医学、基础医学、应用统计学（生物统计学）、医学检验技术、制药学、眼视光学、卫生检验与检疫、生物医学工程、生物信息学、康复治疗学、护理学、公共事业管理（医药贸易与管理）、公共事业管理（卫生事业管理）、七年制临床医学、七年制口腔医学、六年制公共事业管理（卫生事业管理与法学）、六年制法医学（医学司法鉴定）。
这些专业在各校中均具有较高的学术地位和就业前景，建议根据个人兴趣和职业规划进行选择。