国内三本院校的学生想要考取东京大学研究生，确实存在一定的难度，但并非不可能。以下是一些可能有助于实现这一目标的建议：
提升自身实力
学习成绩：保持优秀的学习成绩，尤其是英语和数学，这两门课程在申请东京大学时非常重要。
语言能力：东京大学要求具备日语N1级成绩，文科生要求N1级140分以上。如果日语水平不够，可以考虑先申请其他日本大学，有机会再考取东京大学。同时，托福成绩也是必要的，一般要求托福90分以上。
课外活动：参加一些国际性的大赛获奖或者音乐、体育成绩突出，这些都可以成为你的闪光点，增加申请的成功率。
选择合适的申请策略
提前规划：尽早准备，了解东京大学的申请条件和流程，做好充分的准备。
申请普通日本大学：可以先申请一个普通的日本大学读硕士，有机会再考取东京大学。
利用奖学金：有些情况下，申请者可能会获得折合人民币一万多元的奖学金，这可以减轻经济压力。
考虑其他途径
去日本参加高中考试：在日本参加高中生考试，考上东京大学的概率可能比在国内大一些。这种方式需要提前规划，并且要克服语言和生活方面的挑战。
结论
虽然国内三本院校的学生考取东京大学存在一定的难度，但通过提升自身实力、选择合适的申请策略以及考虑其他途径，仍有一定的机会实现这一目标。建议尽早准备，全面提升自己的综合素质和语言能力，同时保持积极的心态和耐心。