海关专业的军校大学排名如下：
上海海关学院
上海海关学院是中国海关总署直属的唯一一所全日制普通高等本科院校，始建于1953年。该校在海关管理领域享有极高的声誉，特色专业包括海关管理、海关检验检疫安全等，均在全国处于领先地位。毕业生就业前景广阔，多从事海关、国际贸易及相关领域的工作。
对外经济贸易大学
对外经济贸易大学是教育部直属的全国重点大学，国家“211工程”首批重点建设高校。该校的海关管理专业在全国排名名列前茅，拥有雄厚的师资力量和丰富的教学资源。
国际关系学院
国际关系学院以外语、国际问题为教学科研的全国重点大学，其学科设置和研究方向与海关、国际贸易等领域有着密切的联系。该校注重培养学生的国际视野和跨文化交流能力，为海关、国际贸易等领域培养了大量专业人才。
大连海事大学
大连海事大学以海事著称，其海事管理、物流管理等专业在国内处于领先地位。该校还承担海关干部教育培训以及海关理论与政策研究等任务，为海关系统输送了大量高素质人才。
海军军医大学
海军军医大学属于军校，虽然学校并没有参加大学排名，但其实力强劲，每年都是提前批次录取，招生分数线大都在600分以上。基础医学和药学属于王牌专业，科研水平及实力都很强劲。
建议：
上海海关学院和 对外经济贸易大学在海关管理专业方面具有很高的声誉和就业优势，是报考海关管理专业的首选院校。
国际关系学院和 大连海事大学也具备较强的专业特色和就业渠道，适合有志于从事相关领域工作的学生。
海军军医大学虽然是一所军校，但其海关相关专业的实力也不容小觑，特别是对于有志于从事军事医学和海关工作的学生来说，是一个不错的选择。