南京三本最好的宿舍大学包括：
南京大学：
南京大学拥有多个学生宿舍楼，设施齐全且维护良好，部分宿舍还配备独立卫生间和空调。仙林校区的宿舍规格为4人间，南区公寓式，有空调，有独卫。新生统一入住仙林校区，仙林校区是2009年新建成的校区，因此住宿条件比较好。
南京师范大学：
南京师范大学的宿舍设施先进、安全、整洁，特别是新建的宿舍楼。宿舍规格为4人间，有空调，有独卫。四人间，床铺是上下铺和独立桌柜，还有一台壁挂电视机。此外，南师随园校区和仙林新北区的宿舍条件也非常好，配有阳台、独卫、热水器、饮水机、空调、书桌，甚至还有电视，并且24小时不断电不断网。
金陵科技学院：
金陵科技学院的宿舍在南京也算得上数一数二，最好的宿舍是南区，公寓式格局。三室一厅，铺的都是地砖，客厅挺大，独立卫生间，两个热水器，宿舍24小时提供热水。每室住四人，每小室都有空调，上床下桌式床铺。学生公寓24小时有人值班。
南京中医药大学：
南京中医药大学的宿舍环境也较好，设施完备。
南京邮电大学：
南京邮电大学的宿舍为规格4或6人间，有空调，有独卫。宿舍有走廊，三室一厅，三室共用一个走廊式阳台，基本都是四人间，四人间是上床下桌。
南京理工大学：
南京理工大学的宿舍分为南区和北区。南区3或4个小寝组成一个大寝，共用一个阳台和卫生间，有淋浴可洗热水澡。几乎每栋楼都有洗衣房。北区各楼情况有略微差别，基本为上床下桌有独卫。24小时供水供电。
南京师范大学中北学院：
中北学院的宿舍条件也相对较好，有空调、热水器、电视、独卫等。
三江学院：
三江学院等学校也提供较好的住宿条件。
建议选择宿舍条件较好的学校，以便为学生提供更好的学习和生活环境。