福建工程学院的优势专业包括：
计算机科学与技术：
该专业是福建工程学院的特色专业之一，拥有强大的师资力量和优秀的教学设施，培养了一大批优秀的计算机人才。
自动化：
该专业是一门涉及机械、电子、计算机、控制等多个学科领域的学科，毕业后可从事自动化控制、机器人制造、智能家居等多个方向的工作。
电子信息工程：
该专业是一门涉及电子、通信、计算机等多个学科领域的学科，毕业后可从事电子产品设计、通信网络维护、电子信息系统控制等工作。
土木工程：
该专业是一门涉及建筑、结构、水力、环境等多个学科领域的学科，毕业后可从事建筑设计、水利工程、环境工程等多个方向的工作。
电气工程及其自动化：
该专业培养具备电气工程领域相关的基础理论、专业技术和实践能力，能在电气工程领域的装备制造、系统运行、技术开发等部门从事设计、研发、运行等工作的复合型工程科技人才。
工程造价：
该专业是福建工程学院的王牌专业之一，毕业后可从事工程项目的投资估算、成本控制、进度控制、合同管理等工作。
建筑学：
该专业是福建工程学院的王牌专业之一，培养具备建筑设计、城市规划、室内设计等方面的知识和技能。
软件工程：
该专业入选国家级一流本科专业建设点，培养学生具备软件开发、测试、维护和管理等方面的能力。
建筑环境与能源应用工程：
该专业入选国家级一流本科专业建设点，培养具备建筑环境控制、能源管理、建筑设备等方面的知识和技能。
材料科学与工程：
该专业入选国家级一流本科专业建设点，培养具备材料设计、制备、加工、性能测试等方面的能力。
机械设计制造及其自动化：
该专业入选国家级一流本科专业建设点，培养具备机械系统设计、制造、自动化控制等方面的能力。
给排水科学与工程：
该专业入选国家级一流本科专业建设点，培养具备城市给水排水系统、农村供水排污、工业废水处理等方面的知识和技能。
城乡规划：
该专业入选国家级一流本科专业建设点，培养具备城市总体规划、景观设计、区域发展规划等方面的知识和技能。
这些专业在教学设施、师资力量和就业前景等方面都有显著优势，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业。