测控专业与自动化专业在学科背景、专业方向、应用领域以及课程设置与技能培养等方面存在一定的区别。以下是具体的比较：
学科性质
自动化专业：以数学与自动控制理论为主要理论基础，涉及电子技术、计算机信息技术、传感器与检测技术等。侧重于控制理论的应用，追求通过自动化技术提高生产效率、降低成本、保障安全等。
测控专业：以信息科学技术为核心，涵盖光学、精密机械、电子、电力、自动控制、信号处理、计算机与信息技术等多学科。侧重于测试与控制技术，关注仪器仪表的研发和应用。
专业方向
自动化专业：主要方向包括电气控制、过程控制、机器人技术、自动化设备等。毕业生可在工业生产、交通运输、能源管理等领域从事自动化系统的研发、设计和运行维护工作。
测控专业：主要方向包括测试与控制技术、仪器仪表、传感器技术等。毕业生可在科研、生产、质量检测、能源管理等领域从事测控系统的设计、开发和运行维护工作。
应用领域
自动化专业：应用领域较广泛，包括工业生产、交通运输、建筑、医疗、农业等。自动化技术在这些领域中有着广泛的应用，如生产线自动化、机器人技术、智能交通等。
测控专业：应用领域相对较窄，主要集中在电子、光电、精密机械等领域。测控技术在这些领域中有着重要的应用，如电子测试与控制、仪器仪表研发、传感器应用等。
课程设置与技能培养
自动化专业：课程设置主要包括电气工程、控制理论、计算机科学与技术、传感器与检测技术等。技能培养注重自动化系统的设计、开发、集成、运行和维护。
测控专业：课程设置包括理论力学、材料力学、模电数电、工程制图、PLC等。技能培养注重智能仪器和仪表的研发、测试测量和控制技术的应用。
建议
自动化专业：因其广泛的应用领域和不断发展的技术，具有较好的就业前景和发展潜力。如果你对自动控制和电子技术有浓厚的兴趣，自动化专业可能更适合你。
测控专业：虽然应用领域相对较窄，但在电子、光电、精密机械等领域有着重要的应用。如果你对智能仪器和仪表有特别的兴趣，测控专业也是一个很好的选择。
选择哪个专业应基于个人的兴趣和职业规划。两个专业各有优势，自动化专业更偏向于软件和系统的控制，而测控专业更偏向于硬件和设备的测量与控制。根据你的兴趣和长期发展目标，可以选择适合自己的专业。