福建的民办大学和独立学院都是实施本科学历教育的高等学校，但它们之间存在一些关键的区别：
办学资金来源
公办大学：由国家政府部门举办，资金基本来源于政府财政拨款。
独立学院：由国家机构以外的社会组织或个人合作举办，利用非国家财政性经费。
民办大学：由企业事业组织、社会团体及其他组织和公民个人利用非国家财政性教育经费举办。
学费
由于办学资金来源不同，学费水平也有所不同。一般情况下，民办大学的学费较高，本科通常在20000-30000元/年，专科通常10000元/年左右。
学历证书
独立学院和民办院校的毕业生都可以获得获国家承认的学历证书，毕业证书可以在中国高等教育学生信息网上查询。
社会认可度
公办大学通常社会认可度更高，收费较便宜；民办大学社会认可度相对较低，但也是正规大学，毕业证、学位证等都是在学信网可查的。
转设情况
根据教育部的规定，独立学院可以转为民办或公办高校。目前，福建已有部分独立学院完成转设，性质转为民办。
典型学院
仰恩大学：全国第一所具有颁发国家本科学历证书和授予学士学位资格的私立大学。
泉州信息工程学院：全日制应用型本科高校，荣获多项荣誉。
厦门大学嘉庚学院：由教育部直属重点大学厦门大学与厦门嘉庚教育发展有限公司共同举办的独立学院。
集美大学诚毅学院：由集美大学与福建集美大学教育发展基金会联合举办的独立学院。
福州大学至诚学院：以实践创新为核心，鼓励学生参与各类创业项目与实践活动。
建议
选择学校：学生在选择学校时，可以根据自己的兴趣、专业需求、学费预算以及对学校社会认可度的考量来做出选择。
关注转设动态：独立学院的转设情况是动态变化的，学生和家长需要关注相关政策和信息，以便及时了解学校的最新情况。
希望这些信息对你有所帮助。