南京的三本大学包括以下几所：
南京大学金陵学院
东南大学成贤学院
南京航空航天大学金城学院
南京理工大学紫金学院
南京师范大学中北学院
南京中医药大学翰林学院
南京审计大学
南京工业大学
南京信息工程大学滨江学院
南京工程学院康尼学院
金陵科技学院龙蟠学院
南京医科大学康达学院
南京邮电大学通达学院
南京财经大学红山学院
南京审计大学金审学院
南京化工大学
南京建筑工程学院
建议女生在选择三本大学时，可以综合考虑学校的学科特色、教学质量、就业前景等因素，选择最适合自己的学校和专业。同时，也可以考虑咨询学校的招生办公室或学长学姐，获取更详细的学校信息和录取经验。