二本大学和三本大学的主要区别在于它们的性质、资金来源、社会认可度以及学费等方面：
性质
二本大学：通常是公办的本科院校，它们通常由省级政府拨款扶持，属于普通本科高校范畴。二本大学的实力相对较强，多数为省属大学或非“211工程”大学，在师资和硬件方面与一本大学有一定差距。
三本大学：主要是民办的本科院校，包括独立学院、民办普通本科高校和合作办学本科高校。三本院校通常具有“校园独立、招生独立、财务独立”等特点，部分师资力量与教学设施可能与校本部共享。
资金来源
二本大学：财政直接来自国家政府，因此师资力量强大，国家自动承担部分费用，学费相对较低。
三本大学：由个人或企业拨款筹建，自行管理，学费较高，因为国家不直接承担费用。
社会认可度
二本大学：社会认可度较高，虽然实力稍逊于一本大学，但在省内及行业内的认可度仍然很高。
三本大学：社会认可度相对较低，但随着教育改革的深入，三本院校的教学质量和社会认可度在逐步提高。
学费
二本大学：学费一般在4000-6000元/学年，艺术类专业可能会更高一些。
三本大学：学费较高，一般在14000-17000元/学年。
毕业证书
二本大学：毕业证书上会标明是“本科毕业证书”和“学士学位证书”，通常以学校名称具印。
三本大学：毕业证书和学位证书上也会标明是“本科毕业证书”和“学士学位证书”，但以独立学院名称具印。
建议
对于考生：在选择二本还是三本大学时，建议综合考虑自己的分数、兴趣、职业规划以及家庭经济情况。虽然三本大学的学费较高，但如果其教学质量和就业情况符合个人期望，也是一个不错的选择。
对于高校：无论是二本还是三本，都应注重提升自身的教育质量和科研实力，以获得更好的社会认可度和就业前景。
希望这些信息对你有所帮助。