西南大学设有多个学院，以下是部分学院的列表：
1. 政治与公共管理学院
2. 经济管理学院
3. 法学院
4. 文化与社会发展学院
5. 教育科学学院
6. 师范学院
7. 心理学院
8. 体育科学学院
9. 化学化工学院
10. 材料与能源学院
11. 地球科学与资源学院
12. 生命科学学院
13. 数学与统计学院
14. 物理科学与技术学院
15. 电子信息工程学院
16. 历史文化与学院
17. 民族学院
18. 外国语学院
19. 新闻传媒学院
20. 音乐学院
21. 美术学院
22. 工程技术学院
23. 纺织服装学院
24. 食品科学学院
25. 园艺园林学院
26. 农学与生物科技学院
27. 植物保护学院
28. 动物科技学院
29. 药学院
30. 中医药学院
31. 应用技术学院
32. 育才学院（独立二级学院）
此外，西南大学还设有中国式现代化研究院等研究机构。