南京的三本大学中，有几所是比较好的选择，具体如下：
南京大学金陵学院
位于南京大学浦口校区，校园风景秀丽，环境优美，被誉为“南京最美的十所高校”之一。
继承和发展了南京大学的教学资源和学术氛围，在文科和理工科方面都有出色的表现，培养出了一批优秀的毕业生。
南京审计大学金审学院
以财经类专业著称，随着国家对于财经类人才的需求增加，该校的毕业生在就业市场上具有极高的竞争力。
师资力量雄厚，教学设施完备。
东南大学成贤学院
作为东南大学的重要组成部分，继承了东南大学的优良传统，在工科领域具有优势，培养了大量的工程技术人才。
学校注重实践教学，为学生提供了丰富的实践机会。
南京理工大学紫金学院
南京理工大学旗下的三本学院，依托南京理工大学的资源，理工科专业较强。
南京航空航天大学金城学院
南京航空航天大学旗下的三本学院，在航空、航天等工科领域有一定的优势。
南京理工大学泰州科技学院
中国顶尖独立学院之一，以农业科学为主要特色，拥有一流的农业科研实力和教学资源。
南京师范大学中北学院
经教育部批准，由南京师范大学和南师大教育发展基金会合办，拥有较强的师资力量和教学设施。
南京中医药大学翰林学院
以中医药专业为特色，依托南京中医药大学的资源，中医药学科实力较强。
这些学校在教学资源、师资力量、专业设置和实践教学等方面都有各自的优势，建议根据个人的兴趣、专业方向和就业需求来进行选择。