民办大学本科存在的缺点主要包括以下几个方面：
学费昂贵：
民办大学的学费普遍高于公立大学，给许多家庭带来经济压力。
教育资源有限：
由于主要依赖学费，民办高校可能在教学设施和师资力量上不如公立高校。
招生名额有限：
竞争激烈，部分学生可能因名额不足而无法就读。
办学时间短：
一些私立大学的办学经验相对较少，可能导致教学质量和学术研究水平较低。
课程设置偏向市场需求：
与企业合作较多可能导致课程更侧重于市场需求，而忽视学术深度。
社会认可度较低：
私立大学学历可能在就业市场上受到一定程度的歧视，影响毕业生的就业前景。
管理混乱：
部分私立大学可能存在管理不善的问题，影响学生的学习体验和校园环境。
毕业证书含金量低：
在就业市场上，私立大学的毕业证书可能不如公立大学受认可。
过分追求经济利益：
一些私立高校可能过度商业化，忽视教育质量和社会责任。
可持续发展压力：
缺乏稳定的政府资金支持，私立高校可能面临资金压力，影响其长期发展。
综上所述，民办大学本科教育在学费、教育资源、社会认可度等方面存在明显的不足，这些缺点可能会对学生的学业和未来的就业、升学产生不利影响。因此，在选择民办本科时，学生和家长需要充分考虑这些因素，做出明智的选择。