在嘉兴市，最好的三所民办大学分别是：
浙江财经大学东方学院
浙江财经大学东方学院在2023年校友会中国民办大学排名中位居嘉兴市首位，全国排名第64名。该学院是经中华人民共和国教育部批准成立的民办全日制普通本科独立学院，也是浙江省应用型建设试点示范本科高校。
同济大学浙江学院
同济大学浙江学院同样位于嘉兴市，是一所以同济大学名义举办的本科民办学院。在2023年校友会中国民办大学排名中，该学院也表现优异。
嘉兴南湖学院
嘉兴南湖学院是嘉兴学院的二级学院，也在2023年校友会中国民办大学排名中位列嘉兴市第二名，全国排名第516名。
综上所述，这三所民办大学在嘉兴市乃至浙江省内均具有较高的教育质量和学术水平，是当地学生和家长信赖的选择。建议有意向就读民办大学的学生可以优先考虑这三所学校。