三本大学涨学费的合法性主要取决于涨价过程是否符合相关法律法规和政策规定。以下是具体的分析：
物价部门审批
学校涨学费需要经过物价部门的审批。如果物价部门批准了涨价，那么涨价行为是合法的。
如果未经物价部门批准，学校擅自涨学费，则属于教育乱收费，是违规的，学生可以向物价部门举报。
法规和规定
大学学费的涨价必须符合相关法规和规定，如《中华人民共和国价格法》等。定价部门可以根据实际情况，对必要的服务调整价格，但需要符合公平、公正、公开的原则，并要听取有关方面的意见建议。
学校在涨价前必须公开透明地说明涨价原因，并且尽可能地为学生提供帮助减轻费用负担，如设立奖学金、减免部分学费等措施。
学校审批和公示
除了物价部门的审批外，学校内部的涨价也需要经过相关部门的审核和批准，并且需要公示，确保合法合规。
学生权益
对于已经入学的学生，学费的涨价应当考虑到学生的利益和权益，不能一味地涨价。学校应该采取合理措施，确保学生的负担不会因涨价而过重。
综上所述，三本大学涨学费是否合法，主要看其涨价过程是否经过了物价部门的审批以及是否符合相关的法律法规和政策规定。如果涨价过程合法合规，并且学校公开透明地说明了涨价原因并采取了减轻学生负担的措施，那么涨价是合法的。否则，学生可以向相关部门举报，维护自己的权益。