在省会城市的三本大学包括：
南京
南京理工大学
南京农业大学
南京林业大学
南京师范大学
南京审计大学
南京体育学院
南京艺术学院
南京医科大学
南京邮电大学
太原
山西应用科技学院
山西大学商务学院
太原理工大学现代科技学院
中北大学信息商务学院
成都
成都东软学院
四川传媒学院
电子科技大学成都学院
成都信息工程大学银杏酒店管理学院
石家庄
石家庄学院
太原学院
沈阳大学
武汉
华中科技大学武昌分校
华中科技大学文华学院
吉林大学珠海学院
浙江大学城市学院
四川大学锦江学院
云南师范大学商学院
燕山大学里仁学院
西安
西京学院
哈尔滨
黑龙江东方学院
北京
北京城市学院
合肥
合肥大学（原合肥学院）
这些大学在各自的省会城市具有一定的知名度和特色，涵盖了工、理、文、经、管、法、教育等多个学科领域。建议在选择三本大学时，可以综合考虑学校的学科优势、师资力量、就业情况等因素。