云南环境最好的三本大学有以下几所：
云南大学滇池学院：
云南大学滇池学院是2000年经云南省教育厅和云南省计委批准建立的公办民助新型综合二级学院，2004年经国家教育部批准试办独立学院。学院有两个校区，提供50个本科专业和多个专业方向。
云南师范大学商学院：
云南师范大学商学院是经教育部审批，由云南师范大学利用社会投资举办的独立学院，属普通高等教育本科层次。学院设有多个二级学院，开设有45个本科专业和60多个专业方向。
云南大学旅游文化学院：
云南大学旅游文化学院是云南滇西北唯一一所本科院校，由云南大学申办并经教育部批准，于2002年在丽江创办，2004年经国家教育部确认的独立学院。学院在高等教育的改革与高层次旅游管理及相关专业人才培养方面具有独特优势。
昆明医学院海源学院：
昆明医学院海源学院是云南省的一所三本院校，提供多个本科专业和方向。
云南师范大学文理学院：
云南师范大学文理学院是云南省的一所三本院校，提供多个本科专业和方向。
昆明理工大学津桥学院：
昆明理工大学津桥学院是云南省的一所三本院校，提供多个本科专业和方向。
这些学院在环境方面都有各自的特点和优势，具体哪个学院的“环境最好”可能需要根据个人的需求和偏好来决定。建议你可以亲自去这些学院实地考察，了解校园环境、教学设施以及学生生活条件等方面的信息，以便做出更为明智的选择。