南京的二本和三本大学包括以下几所：
二本大学：
1. 南京工业大学
2. 南京工程学院
3. 南京医科大学
4. 南京邮电大学
5. 南京中医药大学
6. 南京晓庄学院
7. 河海大学
8. 南京师范大学
9. 解放军理工大学
10. 南京信息工程大学
11. 南京林业大学
12. 南京工业职业技术大学
13. 南京传媒学院
14. 三江学院
三本大学：
1. 东南大学成贤学院
2. 南京大学金陵学院
3. 南京理工大学紫金学院
4. 南京航空航天大学金城学院
5. 南京理工大学泰州科技学院
6. 南京师范大学泰州学院
7. 中国传媒大学南广学院
8. 南京医科大学康达学院
9. 南京中医药大学翰林学院
10. 南京信息工程大学滨江学院
11. 南京邮电大学通达学院
12. 南京财经大学红山学院
13. 南京审计学院金审学院
14. 南京工业大学浦江学院
15. 金陵科技学院龙蟠学院
16. 南京特殊教育师范学院
17. 南京体育学院
18. 南京传媒学院
19. 三江学院
建议学生在选择学校时，可以综合考虑学校的学科优势、师资力量、就业情况以及个人兴趣和发展方向。