南方的二本和三本大学包括：
1. 厦门大学，位于福建省厦门市，是一所综合性大学，以多学科研究实力著称。
2. 华南师范大学，位于广东省广州市，以师范教育为主，涵盖多学科领域。
3. 广东工业大学，位于广东省广州市，以工科为主，尤其在信息工程、机械工程等领域表现突出。
4. 南方医科大学，位于广东省广州市，以医学为特色，在临床医学、药学等领域有较高学术水平。
5. 桂林电子科技大学。
6. 福州大学。
7. 上海工程技术大学。
8. 广东金融学院，在金融学科方面有着明显的优势，是金融类专业学生的理想选择。
9. 南京审计大学。
10. 南京晓庄学院。
11. 南京工程学院，位于江苏省南京市，以工科专业为主，尤其在材料成型及控制技术、机械设计与自动化、电子通信工程等领域表现突出。
12. 广东海洋大学，这所位于湛江市的高校，专注于海洋科学与技术，以其独特的地理位置和丰富的专业设置（如水生生物学和水产养殖学）而闻名。
13. 成都信息工程大学，作为气象行业的重要人才培养基地，位于四川省成都市，开设大气科学、应用气象学等专业，其毕业生在相关领域备受欢迎。
14. 南昌大学，作为江西省的重点大学，南昌大学的研究生教育在南方地区颇具影响力，尤其是在工程和医学领域。
建议根据个人兴趣和职业规划，仔细研究每所大学的优势专业、地理位置、校园环境等因素，选择最适合自己的学校。