在东莞的民办大学中， 广东科技学院和 东莞理工学院城市学院是较为知名且实力较强的院校。
广东科技学院
全国排名：85名
办学层次：区域一流民办大学
专业设置：以工学为主，管理学、经济学、文学、艺术学等多学科协调发展
荣誉与认证：入选教育部首批国家级新工科研究与实践项目、教育部“网络学习空间人人通”专项培训基地
东莞理工学院城市学院
全国排名：62名
办学层次：中国高水平独立学院
合作背景：由东莞理工学院和广东鸿发投资集团有限公司合作举办
教学水平：国内最早的一批独立学院之一，具有较高的教学水平和学术实力
从以上信息可以看出，广东科技学院在民办大学中的排名较高，且专业设置较为全面，同时获得了多项荣誉和认证。东莞理工学院城市学院虽然排名略低，但作为东莞理工学院的合作独立学院，其教学水平和学术实力也得到了广泛认可。
建议：
如果你更看重学校的整体实力和学科全面性，广东科技学院是较好的选择。
如果你更倾向于选择与东莞理工学院合作、教学水平较高的独立学院，东莞理工学院城市学院也是一个不错的选择。