三本大学并不都是独立学院。三本大学主要是指 独立学院本科院校等，它们是公办民助范畴的大学。独立学院是依靠母体高校的名声独立进行办学，但并非所有的三本大学都是独立学院，也有可能是民办类院校或其他类型的本科院校。
随着教育改革的推进，一些三本院校已经改名脱离原来的母体高校，成为独立的民办三本院校，开始独立办学。但也有一些三本院校仍然隶属于原来的母体高校，作为其下属的独立学院存在。
此外，需要注意的是，虽然三本大学的学费较贵，但它们都是正正规规的由国家教育部批准的大学，毕业生可以取得本科学历，并非野鸡大学。
综上所述，三本大学包括独立学院，但也可能包括其他类型的民办院校。在选择三本大学时，考生应当仔细了解学校的性质和办学情况，以确保选择到合适的院校。