三本大学毕业生考取清华大学博士研究生的难度是相当大的。虽然存在一些成功的案例，例如通过联系实验室做实验和毕业设计来获得录取机会，但整体来说，由于清华大学对研究生招生有较高的要求，三本院校毕业生在竞争上处于不利地位。以下是一些具体的难点和建议：
学历要求
清华大学要求报考者具备硕士学位，并且通常更倾向于985或211高校的毕业生。
对于在职非全日制博士项目，可能还需要具备一定的工作经验。
竞争激烈
清华大学每年有大量的申请者，而导师的名额有限，导致竞争非常激烈。
尽管有些情况下，三本院校的学生可能因为某些突出表现获得导师青睐，但这并不是普遍情况。
申请流程
清华大学实行“申请-审核”制，需要准备一系列申请材料，包括成绩单、研究计划书、推荐信等。
研究计划书需要体现出对专业领域的深入理解和研究兴趣，推荐信则能增加申请者的竞争力。
面试表现
面试是录取过程中的重要环节，三本院校毕业生在面试中可能没有优势，除非能在专业知识和英语能力上表现出色。
建议
提前准备：大三时就开始联系清华大学的实验室或导师，争取获得实验和毕业设计的机会，以展示自己的实践能力和研究潜力。
提升学术能力：在本科期间，尽量提高自己的学术成绩，并在核心期刊上发表文章，以增加自己的竞争力。
准备充分：认真准备申请材料，尤其是研究计划书，体现出对专业的深入理解和研究思路。
注重英语能力：提高英语水平，尤其是口语和写作能力，以便在面试和申请材料中展现流利的英语沟通能力。
寻求帮助：多向学长学姐请教，利用各种资源来提高自己的申请成功率。
虽然三本院校毕业生考取清华大学博士研究生的难度较大，但通过努力和充分的准备，仍有可能实现这一目标。重要的是要尽早准备，全面提升自己的学术和实践能力，并在申请过程中展现出自己的优势。