哈佛大学由多个学院组成，每个学院下设有不同的系别。以下是哈佛大学的部分学院及其下属的系别：
哈佛学院（Harvard College）
文理系（Faculty of Arts and Sciences）
文理研究生院（Graduate School of Arts and Sciences）
化学系（Department of Chemistry）
应用科学部（Division of Applied Sciences）
生物科学部（Division of Biological Sciences）
计算机技术研究中心（Center for Computer Science）
地质学系（Department of Earth and Planetary Sciences）
哈佛商学院（Harvard Business School）
商业系（Business School）
哈佛大学法学院（Harvard Law School）
法学系（Law School）
哈佛大学医学院（Harvard Medical School）
医学系（Medical School）
细胞与进化生物学系（Department of Cellular and Molecular Biology）
生物化学系（Department of Biochemistry）
微生物学系（Department of Microbiology）
药物学系（Department of Pharmacology）
神经生物学系（Department of Neurobiology）
生物学与生物物理学系（Department of Biology and Biophysics）
免疫学委员会（Division of Immunology）
与MIT合建的健康科学部（Joint Program with MIT in Health Sciences and Technology）
哈佛大学教育学院（Harvard Graduate School of Education）
教育系（Education School）
哈佛大学公共卫生学院（Harvard T.H. Chan School of Public Health）
公共健康系（School of Public Health）
哈佛设计学院（Harvard Graduate School of Design）
设计系（Design School）
哈佛神学院（Harvard Divinity School）
神学系（Divinity School）
哈佛大学肯尼迪政治学院（John F. Kennedy School of Government）
政府系（Kennedy School of Government）
哈佛工程与应用科学院（Harvard School of Engineering and Applied Sciences）
工程系（School of Engineering and Applied Sciences）
拉德克利夫高等研究学院（Radcliffe Institute for Advanced Study）
无特定系别，提供独立研究机会
哈佛文理博物馆（Harvard Art Museum）
无特定系别，提供艺术和文化的教学和研究
牙医学院（Harvard School of Dental Medicine）
牙医系（Dental School）
哈佛大学提供广泛的本科和研究生专业，涵盖从人文学科到理工科，从商学到法学的各个领域。其教学和研究资源在全球享有极高的声誉