日本大学的排名通常根据不同的标准和来源会有所不同。以下是根据您提供的信息整理的日本三本的排名情况：
日本三本书籍排名（根据参考信息整理）
S级大学（国际超一流大学）
S1：东京大学
S2：京都大学
A级大学（国际一流大学）
A1：大阪大学、名古屋大学、东京工业大学
A2：一桥大学、东北大学、庆应义塾大学
A3：九州大学、北海道大学、早稻田大学
B级大学（国内一流大学）
B1：筑波大学、东京外国语大学、御茶水女子大学、广岛大学、中央大学（法学部）
B2：横滨市立大学、上智大学、神户大学
请注意，这些排名信息可能来源于不同的评价体系和时间，因此排名可能会发生变化。如果您需要最新的排名信息，建议查阅权威的教育评估机构发布的最新排名数据