同一所大学中既有一本又有二本的情况比较常见，主要原因包括：
合并：
有的一本大学和专科院校合并或者和比较差的二本大学合并，这样合并的校区、师资、环境等各方面都会有差距，所以那些合并学校的部分或全部专业就可能在本科第二批次招生。
专业热度/实力差距：
学校的专业有强弱、冷热之分。通常来说，学校的优势学科、专业，以及就业好的专业会在一本招生，而相对弱一些的、就业差一些的专业会放在二本招生。
主校区和分校区的差异：
有的学校分好几个校区，分校区远离主校区，新开设的校区分设的专业建设并不完善，整体的师资力量、硬件设备和资源都与主校区有一定的差距，因此家长和考生通常认为分校差一些，这种情况影响就业，所以在招生时会考虑降批次录取。
新办的冷门专业或者只针对省内办的专业：
很多学校有一些响应国家或者省里号召办的专业，这些专业师资力量弱，就业很一般或者有些本来就只对省内招生，这些专业也会在二本招生。
认可度不同：
省内外认可度不一致，在某省认可度高，就会放在一批录取，在认可度低的省份就会放在本科第二批次招生。
地域保护：
还有一些学校对本省有地域保护，所以放在本科第二批次招生。
虽然一本和二本在录取批次和专业实力上存在差异，但同一所大学的一本和二本毕业生在学历上是没有区别的，都会获得本科毕业证书。随着高等教育的普及和高校之间的竞争加剧，越来越多的二本高校正在不断提升自身的办学水平和综合实力，一些二本专业的就业前景和学术影响力也在逐步增强。