民办大学管理混乱严重影响教育教学的情况，根据《民办教育促进法实施条例》（国务院令第399号）第五十一条和《中华人民共和国民办教育促进法》第六十二条的规定，可能会受到以下处罚：
责令限期改正：
由审批机关或者其他有关部门要求民办学校限期改正，并给予警告。
违法所得处理：
如有违法所得，将退还所收费用后没收违法所得。
严重情况下的处罚：
在情节严重的情况下，可能会被责令停止招生或吊销办学许可证。
刑事责任：
如果构成犯罪，将依法追究刑事责任。
此外，民办高校在管理上可能存在的问题包括：
管理队伍不稳定：工作强度大，缺乏创新，制度不规范。
缺乏重视：很多民办高校缺乏对行政管理工作的重视，行政管理人员未能有效解决工作中存在的问题。
制度不完善：民办高校在行政管理体制上存在不完善的问题，各部门之间缺乏沟通和交流。
缺少专业人才：民办高校缺乏专业的行政管理人才，未对行政管理人员进行专业化的培训。
建议民办高校加强对行政管理工作的重视，完善行政管理制度，引进和培养专业的行政管理人才，以提高管理效率和服务质量，从而保障教育教学的正常进行和学校的健康发展。