南通大学截至2024年10月设有 25个学院和 1个独立学院（杏林学院），具体院系如下：
文学院（楚辞研究中心）
数学与统计学院
物理科学与技术学院
马克思主义学院
教育科学学院
教师教育学院
外国语学院
化学化工学院
机械工程学院
信息科学技术学院
交通与土木工程学院
体育科学学院
公共卫生学院
纺织服装学院
电气工程学院
生命科学学院
理学院
政治学院
商学院（管理学院）
杏林学院（本三）
艺术学院（建筑学院）
继续教育学院
国际教育交流学院
南通大学附属医院
建议关注南通大学的官方网站以获取最新的院系设置和专业信息，因为学校可能会有新的院系成立或现有院系进行调整。