截至2024年，菏泽学院拥有69个本科专业，涵盖文学、历史学、经济学、法学、理学、工学、农学、教育学、管理学、艺术学十大学科门类。具体专业设置如下：
文学与传媒学院：
汉语言文学、广播电视学、广告学、历史学等。
外国语学院：
英语、日语、商务英语等。
数学与统计学院：
数学与应用数学（师范类）、信息与计算科学、统计学等。
物理与电子工程学院：
物理学（师范类）、电气工程及其自动化、电子信息科学与技术等。
化学化工学院：
化学（师范类）、应用化学、化学工程与工艺、能源化学工程等。
生命科学学院：
生物科学（师范类）、生物工程等。
农业与生物工程学院（牡丹学院）：
园艺、设施农业科学与工程、食品科学与工程等。
机电工程学院：
机械电子工程、自动化、材料成型及控制工程等。
计算机学院：
计算机科学与技术、网络工程、物联网工程等。
城市建设学院：
土木工程、自然地理与资源环境、建筑学等。
药学院：
制药工程、动物科学、动物医学、生物制药等。
商学院：
经济学、金融学、财务管理、物流管理等。
教育与体育学院：
学前教育、特殊教育（师范类）、心理学（师范类）、体育教育（师范类）等。
人文与新闻传播学院：
社会工作、思想政治教育（师范类）、劳动与社会保障等。
美术与设计学院：
动画、美术学（师范类）、视觉传达设计、环境设计等。
音乐与舞蹈学院：
音乐学（师范类）、音乐表演、舞蹈学等。
创新创业学院：
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继续教育学院：
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远程教育学院：
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国际交流学院：
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建议：
菏泽学院的专业设置较为全面，涵盖了多个学科门类，可以根据个人兴趣和职业规划选择适合的专业。
学校拥有多个省级一流本科专业和高水平应用型专业群，这些专业在教学质量和就业前景方面具有较大优势。
建议关注学校最新的专业设置和招生计划，以获取最准确的信息。