内蒙古大学拥有多个王牌专业和特色专业，以下是一些被广泛认可的专业：
国家级特色专业
数学与应用数学
生物科学
中国少数民族语言文学
物理学
化学
计算机科学与技术
生态学
内蒙古自治区级品牌专业
生态学
环境科学
蒙古语言文学
生物学
其他王牌专业
数据科学与大数据技术
软件工程
中国语言文学
环境/生态学
哲学
政治学与行政学
纪检监察专业
双一流学科
生物学
国家重点学科
中国少数民族语言文学
动物学
国家重点（培育）学科
生态学
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