民办大学用地申请流程通常包括以下几个步骤：
申请阶段
确定申请对象，并向当地政府提出用地申请。
提交申请材料，如学校章程、办学许可证、土地使用申请表、土地权属证明文件、建设规划许可证等。
审批阶段
相关部门对申请材料进行审核，确保材料的真实性和完整性。
征求当地政府、村民委员会等利益相关方的意见，并进行公示。
根据相关法律法规和政策规定，审批部门作出是否批准用地的决定。
规划设计阶段
委托具有相应资质的设计单位进行规划设计，确保用地符合相关标准和规范。
编制校园建设规划方案，包括建筑布局、功能分区、绿化景观等。
当地政府组织相关部门对规划方案进行审查，确保方案符合要求。
建设阶段
办理建设用地规划许可证、建设工程规划许可证等手续。
根据《建设用地规划许可证》办理土地使用权出让手续。
支付土地使用权出让金，并与政府签订土地使用权出让合同。
进行土地登记，确保土地权益合法有效。
在整个过程中，民办大学需遵守国家土地政策和法规，确保土地使用合法合规。此外，根据《民办教育促进法》，民办学校申请土地时，政府可能会根据学校的性质（非营利性或营利性）提供不同的用地优惠政策。
请注意，以上流程可能因地区而异，具体操作时应以当地政府的具体规定为准。如果您需要更详细的指导或帮助，请咨询当地的教育局或国土资源管理部门