普通大学的二本和三本主要区别在于它们的性质、社会认可度、录取分数线以及学费等方面：
高校性质
二本：主要是省属本科院校和普通公办本科院校，综合实力通常低于在高考进行本科一批录取的院校。
三本：包括独立学院、民办普通本科高校和合作办学本科高校，这些学校大多是原来的专科升格而成，属于民办性质。
社会认可度
二本：由于以公办高校为主，社会认可度较高。
三本：由于以民办性质为主，社会认可度相对较低。
录取分数线
二本：通常分数线较一本低，但各省情况不同，有些省份的二本院校录取分数线也可能很高。
三本：录取分数线通常较低，比二本更低。
学费
二本：学费相对较低，因为它们大多是公办高校。
三本：学费较高，因为它们是民办或合作办学高校。
毕业证书
二本：毕业证书上学校名称和钢印一般叫“某某大学”或“某某学院”。
三本：毕业证书上学校名称和钢印一般叫“某某大学某某学院”。
就业情况
二本：由于分数较高且为公办高校，就业优势相对明显。
三本：虽然也是本科学历，但在就业市场上可能会受到一定程度的限制。
教育改革
二本三本合并：一些省份已经将二本和三本合并为一个批次录取，合并后的本科二批分数线相当于曾经的本科三批分数线。这种改革使得原本只能上三本的学生有机会读公办的二本院校。
建议
选择学校：考生可以根据自己的分数和职业规划，综合考虑学校的性质、社会认可度、就业情况等因素来选择合适的学校。
关注改革：随着教育改革的深入，未来的录取批次和办学层次可能会进一步调整，考生需要关注相关政策和信息。
希望这些信息对你有所帮助。