南京的三本大学 是收费的。根据最新的信息，南京三本大学的学费大致在12000-20000元/年之间，具体费用可能会因学校和专业而有所不同。例如，南京理工大学紫金学院的学费范围是14000-17000元/年，住宿费为500元/年；南京理工大学泰州科技学院的学费范围也是14000-17000元/年，住宿费为400元/年。此外，也有信息称三本学费一般至少1万元，甚至有的专业每年学费可能达到2万元，相当于公办大学四年的学费总和。
因此，如果您考虑报考南京的三本大学，除了需要考虑分数因素外，还应充分考虑家庭的经济状况，以确保能够承担得起学费和其他相关费用。