重庆医科大学的专业中，以下几个被广泛认为是王牌专业，并且具有很高的声誉：
临床医学
临床医学专业在重庆医科大学中排名第一，分数线最高，是该校最好的专业。
临床医学（5+3）一体化专业，第一年在西南大学培养，硕士段培养方向为儿科学。
儿科学
儿科学实力非常强，源于现在的复旦大学上海医学院，建有国家儿童健康与疾病临床医学研究中心和儿童发育重大疾病国际科技合作基地。
生物医学工程
生物医学工程专业在全国第四轮学科评估中位列B+等级，是该校的特色专业之一。
口腔医学
口腔医学专业也是该校的王牌专业之一，实力较强。
医学检验
医学检验专业在重庆医科大学中也有很好的口碑。
护理学
护理学专业在全国普通院校中排名第一，并且就业前景非常好。
药学
药学专业的实力也较强，属于该校的好专业之一。
基础医学
基础医学在全国第四轮学科评估中位列B-等级，也是该校的好专业之一。
这些专业不仅在学术上有着较高的地位，而且在实际应用和就业方面也表现出色。建议考生在报考时，可以优先考虑这些专业。当然，具体选择专业还需根据个人兴趣和职业规划来决定。