牛津大学共有 39个学院，其中6个是准学院，称为“永久性私人学堂”。这些学院分布在市中心及周边地区，并没有中心校园，每个学院都有自己的院徽，但没有校门和围墙。以下是部分学院的名称：
1. 万灵学院（All Souls College）
2. 贝利奥尔学院（Balliol College）
3. 布雷齐诺斯学院（Brasenose College）
4. 基督教堂学院（Christ Church）
5. 基督圣体学院（Corpus Christi College）
6. 艾克塞特学院（Exeter College）
7. 格林坦普顿学院（Green Templeton College）
8. 哈里斯˙曼彻斯特学院（Harris Manchester College）
9. 赫特福德学院（Hertford College）
10. 耶稣学院（Jesus College）
11. 基布尔学院（Keble College）
12. 凯洛格学院（Kellogg College）
13. 玛格莉特夫人学堂（Lady Margaret Hall）
14. 李纳克尔学院（Linacre College）
15. 林肯学院（Lincoln College）
16. 莫德林学院（Magdalen College）
17. 曼斯菲尔德学院（Mansfield College）
18. 墨顿学院（Merton College）
19. 新学院（New College）
20. 纳菲尔德学院（Nuffield College）
21. 奥里尔学院（Oriel College）
22. 彭布罗克学院（Pembroke College）
23. 王后学院（The Queen‘s College）
24. 拉斯金学院（The Ruskin College）
25. 圣安学院（St Anne’s College）
26. 圣安东尼学院（St Antony‘s College）
27. 圣十字学院（St Cross College）
28. 萨默维尔学院（Somerville College）
29. 三一学院（Trinity College）
30. 圣约翰学院（St John’s College）
31. 圣彼得学院（St Peter’s College）
32. 圣希尔达学院（St Hilda’s College）
33. 奥里尔学院（Oriel College）
34. 伍斯特学院（Worcester College）
35. 瓦德汉学院（Wadham College）
36. 圣艾德蒙学堂（St Edmund Hall）
此外，牛津大学还有一个继续教育学院。
各学院规模不等，但都在500人以下，学生、教师（院士）来自不同的专业学科。牛津的学院系统产生于大学诞生之时，并逐渐成为牛津市独立机构的集合体。