北京三本大学中公办与民办的主要区别体现在以下几个方面：
性质与学费
公办三本大学是利用国家资金和教育教学资源办学，具有较强的权威性和社会公认性。学费相对较低，一般在几千元每年。
民办三本大学则是由民间投资建校，学费较高，通常在1万元以上。
管理方式
公办三本大学由各大高校负责管理，资源共享，教育质量和教学水平相对较高。
民办三本大学通常自主管理，虽然有些学校与公办大学有附属关系，但整体教育资源和管理模式与公办大学有所不同。
毕业证书
公办三本大学的学生拿的是公办大学的学位，毕业证书上会注明是XX大学XX学院。
民办三本大学的学生拿的是民办学院的学位，毕业证书上会注明是XX学院。
社会认可度
公办三本大学由于有国家教育部门的直接管理，社会认可度较高。
民办三本大学虽然也是本科，但社会认可度相对较低，尤其是在就业市场上，企业更倾向于招聘公办本科毕业生。
学生未来规划
公办三本大学更注重学生的学术研究和考研，有较多的课题研究和教师指导。
民办三本大学更注重学生的实践能力和就业情况，很多学校会与企业合作，提供更多的实习和就业机会。
建议
如果家庭经济条件允许，且对学术研究和考研有较高追求，公办三本大学是更好的选择。
如果家庭经济条件有限，但希望获得本科学历并快速就业，民办三本大学也是一个可以考虑的选项。不过，在选择民办三本大学时，建议仔细考察学校的教学质量和就业情况，以确保能够获得满意的回报。