民办大学毕业生存放档案的方法如下：
全日制大学毕业生
已就业且公司无档案管理权：可以申请将档案存放在学校保存两年，之后需尽快转移到工作单位所在地或原户籍地的人才市场。
已就业且公司有人事管理权：可以直接将档案带到工作单位人事部，由单位接收并存档。若单位管理不严格，档案密封完好即可接收。
未就业：可以申请将档案存放在学校保存两年，之后需转移到户籍地的人才市场。
非全日制大学毕业生
学校会将档案发到个人手中，需与第一学历档案合并后，再存放到人才中心进行托管。
特殊情况
如果工作单位是私企且无档案管理权，可以向单位申请开具介绍信，以公司名义存档。人才中心一般不会拒收以公司名义递交的档案。
若学校愿意，也可以将档案以学校名义邮寄到户籍地的人才中心。
建议
提前规划：毕业生应尽早规划档案存放事宜，确保在毕业后的合理时间内完成档案转移和托管。
咨询专业机构：若对档案存放流程不明确，可咨询当地人才市场或毕业学校，获取详细的指导和帮助。
保持档案密封：无论何种情况，都应确保档案在转递过程中保持密封完好，避免因档案损坏而影响后续使用。