三本大学考研选择学校时，可以考虑以下几所院校：
吉林大学：
作为“985工程”和“211工程”建设高校，吉林大学在多个学科领域都有强大的实力，包括理科、工科和文科。该校学术氛围浓厚，导师质量高，历年分数线和报录比也较为理想。
云南大学：
云南大学是“211工程”建设高校，拥有丰富的学科门类和优秀的师资力量。该校在考研方面竞争相对较小，适合三本学生报考。
湖南大学：
湖南大学同样是“985工程”和“211工程”建设高校，以理工科见长，学术氛围浓厚，就业前景广阔。
东北大学：
东北大学是“985工程”和“211工程”建设高校，在工科方面有显著优势，特别是自动化、计算机和医学工程等科目。该校保护一志愿，报考热度不高，性价比较高。
哈尔滨工程大学：
哈尔滨工程大学在工科领域具有很高的声誉，特别是船舶与海洋工程、控制科学与工程等学科。该校对二三本院校不歧视，复试刷人比例较低。
黑龙江大学：
黑龙江大学是一所实力较强的“211工程”建设高校，学科设置全面，师资力量雄厚。该校在考研方面竞争相对较小，适合三本学生报考。
武汉大学：
武汉大学是“985工程”和“211工程”建设高校，以理工科和文科见长，学术氛围浓厚，就业前景广阔。该校竞争压力较大，但实力强大。
华中科技大学：
华中科技大学是“985工程”和“211工程”建设高校，拥有强大的师资力量和丰富的学科门类。该校在考研方面竞争激烈，但性价比较高。
大连理工大学：
大连理工大学是“985工程”和“211工程”建设高校，理科与工科齐头并进，拥有优秀的学科设置和全面的师资力量。该校在考研方面竞争压力适中，性价比较高。
贵州大学：
贵州大学是“211工程”建设高校，位于B区，划线较低，复试刷人比例不高，对统考生较为友好。
河北工业大学：
河北工业大学是“211工程”建设高校，报考热度较低，保护一志愿，性价比较高。
西南交通大学：
西南交通大学是“211工程”建设高校，以工科特别是土木工程专业见长，就业前景广阔。该校招生人数较多，报考人数相对较少，性价比较高。
东华大学：
东华大学是“211工程”建设高校，位于上海，纺织科学与工程全国排名第一。该校学术氛围浓厚，就业前景广阔。
综合考虑以上各点，三本大学在考研选择学校时，可以根据自己的兴趣、专业倾向、地理位置偏好以及竞争压力等因素，选择适合自己的院校。建议进一步了解目标院校的详细招生信息、复试要求等，以确保成功考取研究生。