福建工程学院的特色专业包括：
计算机科学与技术：
该专业是福建工程学院的特色专业之一，拥有强大的师资力量和优秀的教学设施，培养了一大批优秀的计算机人才。
自动化：
该专业是一门涉及机械、电子、计算机、控制等多个学科领域的学科，毕业后可从事自动化控制、机器人制造、智能家居等多个方向的工作。
电子信息工程：
该专业是一门涉及电子、通信、计算机等多个学科领域的学科，毕业后可从事电子产品设计、通信网络维护、电子信息系统控制等工作。
土木工程：
该专业培养掌握各类土木工程学科的基本理论和基本知识，能在房屋建筑、地下建筑、道路、隧道、桥梁建筑、水电站、港口及近海结构与设施工作的人员。
电气工程及其自动化：
该专业培养具备电气工程领域相关的基础理论、专业技术和实践能力，能在电气工程领域的装备制造、系统运行、技术开发等部门从事设计、研发、运行等工作的复合型工程科技人才。
工程造价：
该专业培养掌握工程造价的基本理论和技能，能在建筑、交通、水利等工程领域从事工程建设项目投资、成本控制、造价咨询等工作。
这些专业在国内具有较高声誉和影响力，是福建工程学院的王牌专业，也是国家特色专业建设点。建议学生在选择专业时，可以优先考虑这些特色专业，以获得更好的学习和发展机会。