三本大学和民办大学在多个方面存在区别，主要包括办学性质、办学资历、办学水平、教学设施、师资力量、学费以及社会认可度等。
办学性质和资历
三本大学：通常是指本科层次的普通高校中最低档次的学校，主要招收普通高中生，由中央政府或地方政府投资创办，享受国家财政拨款，属于公办高校。
民办大学：是由社会力量自主投资创办、依法办学、接受社会监督的高等教育机构，其办学经费主要来源于学费和社会捐赠，学历与公办高校具有同等法律地位。
办学水平和资源
三本大学：办学水平相对较高，教学设施、师资力量、学位授权等方面较为全面，能够提供较高质量的教育资源。
民办大学：虽然有些民办大学办学水平较高，但整体上可能不如三本大学，教育资源可能不够全面。
学费
三本大学：学费相对较低，享受国家财政拨款。
民办大学：学费普遍较高，主要依赖学费和其他收入来维持运营。
社会认可度
三本大学：由于是国家重点支持的公立学校，社会认可度相对较高。
民办大学：虽然学历具有同等法律地位，但在就业市场上可能会受到一定程度的认可度限制。
招生对象和教学质量
三本大学：主要招收普通高中生，教学质量和师资力量相对较强。
民办大学：招生标准、教学质量、师资力量等方面存在较大差异，有些民办大学可能存在教学质量不稳定或师资力量不够强大的问题。
学位
三本大学：毕业生可以获得相应的学士学位。
民办大学：毕业生也可以获得相应的学士学位，但社会认可度可能稍低。
建议
选择三本大学还是民办大学，需要根据个人情况和学业规划进行综合考虑。如果注重教育质量和国家支持，三本大学可能是更好的选择。如果考虑个人发展和就业竞争力，民办大学可能更适合那些有较强自我驱动能力和学习能力的同学。同时，也要注意了解不同学校的具体情况和口碑，以便做出更为明智的选择。