北京理工大学设有多个院系，包括：
理学院
原为北京理工大学科学技术学院，2002年更名为理学院。
下设数学系、物理系、化学系、力学系4个系。
设有化学物理学科特区。
拥有7个二级学科博士学位授予点，3个一级学科硕士学位授权点，涵盖20个二级学科硕士学位授权点。
设有数学、物理、化学、力学4个一级学科博士后科研流动站。
开设数学与应用数学、信息与计算科学、统计学、应用物理学、化学、应用化学、理论与应用力学等7个本科专业。
经济管理学院
开设经济学、国际经济与贸易、金融科技3个本科专业。
其中经济学和国际经济与贸易均为“国家级一流本科专业建设点”。
这些院系涵盖了理学、工学、管理学等多个学科领域，为学生提供了广泛的学术和职业发展选择。