南京综合高中在志愿填报时，考生需要注意以下几点：
填报时间：
考生需要在江苏省高考志愿填报的规定时间内（6月28日至7月2日17:00）登录省教育考试院高考志愿填报系统（gkzy.jseea.cn），在“综合评价招生”专栏中填报综合评价招生志愿。
填报方式：
可以登录南京市招生考试信息网（http://njzsw.nje.cn/）或南京市教育局官网（http://jyt.nanjing.gov.cn/）进入模拟志愿填报系统，注册或登录账号，选择填报类型，填写学校和专业志愿，并进行确认和提交。
志愿设置：
综合评价（B类院校）特殊类型志愿实行传统（顺序）志愿方式，分历史等科目类和物理等科目类，设置1个院校志愿，包括6个专业志愿和1个专业服从调剂志愿。
信息核对：
在填报志愿前，要提前了解相关学校的分数线、学校特色、师资力量、教育环境等信息，以便进行合理的选择。填报完毕后，一定要认真核对所填写的志愿，检查填报的学校、专业、代码等信息是否填写正确、是否符合要求，确认后再提交。
其他注意事项：
考生在填报志愿时，还需要注意平衡志愿，既要有跟自己分数相符的学校备选，也要有针对特殊需求的志愿。同时，要合理安排所选拔的学校和专业，综合考虑配合。
通过以上步骤，考生可以顺利完成南京综合高中的志愿填报。建议考生提前准备，仔细核对信息，合理安排志愿，以确保填报过程顺畅。