父亲在高中时期是不允许擅自更改子女的报考志愿的。这种行为侵犯了子女的个人信息权、隐私权和受教育权，并且可能构成犯罪行为。高考志愿是考生根据个人兴趣、未来职业规划及成绩等因素自主选择的，父母应当尊重子女的选择，而不是强制或擅自更改。
即使在中考填报志愿期间，家长可以和孩子协商进行更改，但一旦志愿确认并上报至招生部门，家长便无法再对其进行更改。此外，如果志愿未能录取，考生还可以选择参加征集志愿。
因此，建议家长在子女高考填报志愿时，充分尊重子女的意见和选择，避免任何形式的擅自更改，以免对子女的学业和未来造成不可挽回的影响。