新余职业大学（新余高等专科学校和新余学院）的系部设置如下：
新余高等专科学校
机电工程系
计算机与信息工程系
太阳能科学与工程系
数学与信息科学系
医学与生物工程系
人文科学系
外国语系
经济与管理系
音乐系
美术系
体育系
职业教育部
成人教育部
新余学院
新能源科学与工程学院（新余新能源研究所挂靠）
机电工程学院（工程训练中心，新余工业研究所挂靠）
数学与计算机学院
建筑工程学院
信息工程学院
电气工程及其自动化
机器人工程
电子信息工程
物联网工程
通信工程
软件工程
土木工程
智能建造
护理学
康复治疗学
健康服务管理
请注意，专业设置可能会发生变动，建议以学校最新公布的信息为准。