佩皮尼昂大学提供的专业非常广泛，主要包括：
法律系：
包括国际私法、刑法、建筑法、民法、商法和法学史等。
经济系：
涉及社会与行政经济、经济管理专业等。
管理学院：
包括企业管理、对外贸易等。
理学院：
包括化学、数学、物理、生命科学、材料科学等。
文学与社会科学院：
涵盖英语、地理与领土整治、历史、艺术史、民族语言、应用外语、古代文学与现代文学、法语、社会学等。
技术学院：
包括应用生物、计算机等专业。
旅游和酒店管理学院：
提供旅游管理、酒店管理、国际旅游等。
体育管理：
涉及体育管理专业。
人文专业：
如现代文学、古典文学、对外法语、英语、西班牙语等。
自然科学：
如计算机与数学在自然科学中的应用、物质科学、数学 - 物理、生命科学、环境科学等。
工程学专业：
如电气自动化、物理、化学、环境科学、交通学与后勤学、工业工程等。
佩皮尼昂大学还参与许多地方性的科研项目，并在可再生能源研究、太阳能硕士学位课程等方面具有影响力。