合并过多次的大学包括：
浙江大学：
合并了杭州大学、浙江医科大学、浙江农业大学。
武汉大学：
合并了武汉测绘科技大学、湖北医科大学、武汉水利电力大学等。
四川大学：
合并了原华西医科大学等高校。
中南大学：
合并了原湖南医科大学、湖南师范大学等高校。
山东大学：
合并了山东医科大学和山东工业大学。
中山大学：
历史上曾经合并了中山医科大学、致格书院、岭南大学等，后经过院系调整，部分学院独立成为华南理工大学、华南农业大学、华南医学院、华南师范大学等。
重庆大学：
合并了同济医科大学等高校，提升了学校实力。
哈尔滨工业大学：
合并了三所院校，成为双一流大学。
西北农林科技大学：
合并了7所高校或科研所。
这些合并案例反映了中国高等教育在结构调整和资源整合方面的历程。有些合并取得了显著成效，而有些则未能完全发挥预期效果。合并通常旨在增强学校的综合实力，提高教育质量，以及适应社会经济发展的需要