大学管理制度存在的问题主要包括：
制度内容不完善：
缺乏明确的目标、职责、标准、流程和执行程序，导致制度执行不够规范。
制度执行不到位：
管理人员和工作人员对制度的理解和执行存在差异，影响制度落实。
制度衔接不协调：
管理制度之间缺乏有效衔接，可能存在相互矛盾或衔接不紧密的问题。
制度环节不完善：
存在漏洞和空白，影响管理行为的规范性、科学性和合理性。
制度法律意识不强：
管理人员对法律法规知识掌握不足，可能导致制度制定和执行不符合法律要求。
缺乏明确的目的和范围：
规章制度条款模糊，无法提供清晰指导和规范。
内容繁琐冗长：
规章制度内容复杂，不易理解和执行，增加管理难度。
执行程序不规范：
缺乏明确的执行程序，导致制度执行缺乏统一性和规范性。
责任追究不明确：
对于违规行为的责任追究不明确，难以确保制度有效执行。
管理制度不够完善：
未能全面覆盖学校内部的经营管理、人事管理等问题。
管理制度缺乏灵活性：
过于死板，不能适应学校内部经营管理的变化和发展。
信息不畅通：
各部门之间信息传递不及时或不完整，影响协作效率。
缺少应急处理流程：
突发事件处理不及时或不正确。
权力过于集中：
管理决策通常由少数领导人决定，缺乏民主参与。
职称评定制度问题：
过于注重科研成果和论文数量，忽视教学质量和学生综合素质提升。
评价指标体系不足：
过于关注科研水平，忽视教学质量和学生综合能力培养。
监督机制缺乏：
对制度化管理存在排斥，部分制度本身不科学，执行效果不佳。
规划性欠缺：
难以对全校制度体系进行科学规划，制度数量多、重复性高。
更新不及时：
内部缺乏专门部门跟踪情况变化，及时优化完善制度。
师资队伍问题：
教师业务能力不强，敬业心、责任感欠缺，教学方法落后。
学科建设问题：
交叉学科发展问题，学科定位不明确，规章制度缺失。
针对这些问题，高校应加强民主管理，建立开放透明的决策机制，改革职称评定制度，注重综合能力评价，优化评价指标体系，建立有效的监督手段和纠正措施，以及科学规划全校制度体系等措施来改进管理制度