全中国最好的医科大学有以下几所：
北京协和医学院：
位于全国第21名，是中国最高的医科教育机构，拥有八年制医学教育、高等护理教育等医学教育制度，研发了众多重要医学成果，并为我国众多重要的医学和卫生机构提供了人才与技术支持。
北京大学医学部：
作为中国最顶尖的大学之一，其医学部历史悠久，学科设置齐全，临床医学专业闻名遐迩。其附属医院包括北京大学第一医院、北京大学人民医院等，这些医院在国内外医学界具有举足轻重的地位。
上海交通大学医学院：
成立于1907年，是中国历史最悠久的医学院之一，医学教育质量与国际声誉并驾齐驱，学科覆盖基础医学、临床医学、公共卫生等多个领域。其附属医院包括瑞金医院、新华医院等一流医院。
中山大学中山医学院：
作为广东省的顶尖医学教育机构，其医学专业长期位列全国前列，拥有强大的师资力量和多个国家重点学科。
首都医科大学：
学校的综合排名和学科建设能比肩双一流院校，有2个A类学科、4个B+学科、3个B类学科，11个学科进入ESI全球前1%，其中临床医学进入ESI学科前1‰。
南京医科大学：
拥有国家重点学科3个，13个学科位列ESI全球排名前1%，3个学科列入ESI全球排名前1‰，建有多个医学重点实验室，师资力量强大。
南方医科大学：
前身是中国人民解放军第一军医大学，拥有多个“首批”称号，是广东省最好的医科大学，现有8所附属直属医院，5个国家重点学科。
哈尔滨医科大学：
在全国知名度很高，曾是直属于国家卫生部的，有着接近百年的建校史，文化底蕴深厚。
中国医科大学：
最初是原卫生部的部属高校，背景实力强大，专业中最厉害的是临床医学，在ESI排名前1‰。
北京中医药大学：
国内最好的中医药院校，学术氛围浓厚，是国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”建设高校。
这些医科大学在医学教育、科研实力、附属医院等方面均表现出色，各有其特色和优势。建议根据个人兴趣、专业方向和职业规划，选择最适合自己的医科大学。