东南亚三所顶尖大学的排名如下：
新加坡国立大学（National University of Singapore, NUS）
QS世界大学排名：第8位
特点：新加坡历史最悠久、规模最大、声誉最高的大学之一，涵盖多个学科领域，以优秀的教学和研究水平享有国际声誉。
南洋理工大学（Nanyang Technological University, NTU）
QS世界大学排名：第15位
特点：新加坡政府建立的顶尖大学，以工科和商科并重，在纳米材料、生物材料等领域的研究享有世界盛名。
马来亚大学（University of Malaya, UM）
QS世界大学排名：第60位
特点：马来西亚最古老的大学，以文理学科和医学著称，是马来西亚首屈一指的公立研究型综合大学。
以上排名基于2025年QS世界大学排名的数据。